Από όταν ξεκίνησε στον Πανιώνιο το 2004 μέχρι φέτος που επέστρεψε, ο Γιάννης Μανιάτης έχει καταφέρει να πραγματοποιήσει πολλές εμφανίσεις και να αποκτήσει σημαντικές ποδοσφαιρικές εμπειρίες, συμπληρώνοντας χθες τις 300 συμμετοχές σε αγώνες πρωταθλημάτων.
Ο έμπειρος ποδοσφαιριστής έχει αγωνιστεί σε πέντε διαφορετικούς συλλόγους στην καριέρα του, στην Super League μετράει 258 εμφανίσεις, με τον Πανιώνιο, τον Ολυμπιακό και τον Ατρόμητο, ενώ 34 είναι οι συμμετοχές του στο πρωτάθλημα της Τουρκίας με την Αλάνιασπορ και οκτώ στο πρωτάθλημα Βελγίου με τη Σταντάρ Λιέγης.
Συνολικά στην επαγγελματική του καριέρα με συλλόγους έχει καταφέρει να στείλει την μπάλα στα δίχτυα 21 φορές.
Επίσης, εκτός από τις πολλές συμμετοχές του σε ματς πρωταθλήματος, έχει και αρκετές παρουσίες στις κορυφαίες Ευρωπαϊκές διασυλλογικές διοργανώσεις καθώς έχει αγωνιστεί 22 φορές στο Champions League (και άλλες δύο προκριματικά) και επτά στο Europa League με την φανέλα του Ολυμπιακού, ενώ με τον Πανιώνιο έχει συμμετάσχει σε έξι ματς στο κύπελλο UEFA.