Άλλες 15 φορές έχουν τεθεί αντιμέτωποι Πανιώνιος και ΠΑΟΚ στο Κύπελλο, όπου φέτος θα τα πουν στα ημιτελικά. Ο «Δικέφαλος του Βορρά» έχει την υπεροχή με επτά νίκες, έναντι τεσσάρων των «κυανέρυθρων», ενώ τρία ματς έχουν λήξει ισόπαλα. Πάντως στις προκρίσεις υπάρχει ισορροπία, 3-3, ανάμεσα στις δύο ομάδες.
Αναλυτικά οι αναμετρήσεις και οι σκόρερ των δύο ομάδων στο Κύπελλο:
01/05/55 Προημιτελικά Πανιώνιος - ΠΑΟΚ 2-4 (11’, 75’ Χρονόπουλος - 14’, 32’ Καραφουλίδης, 40’ Κουιρουκίδης, 70’ Γερούδης)
14/06/70 Προημιτελικά ΠΑΟΚ - Πανιώνιος 1-0 (63’ Κούδας)
30/04/75 Προημιτελικά ΠΑΟΚ - Πανιώνιος 1-0 (35’ Τερζανίδης)
31/03/82 Προημιτελικά (1ος αγώνας) ΠΑΟΚ - Πανιώνιος 1-0 (12’ Δαμιανάκης)
28/04/82 Πανιώνιος - ΠΑΟΚ 2-1 (2ος αγώνας) Πανιώνιος - ΠΑΟΚ 2-1 (27’ Σαραβάκος, 75’ Μαυρίκης - 29’ Σίγγας)
21/01/87 2ος γύρος (1ος αγώνας) Πανιώνιος - ΠΑΟΚ 3-0 (5’ πεν. Όουεν, 37’, 48’ Αποσπόρης)
04/02/87 2ος γύρος (2ος αγώνας) ΠΑΟΚ - Πανιώνιος 1-0 (73’ Μπανιώτης)
01/02/89 Προημιτελικά (1ος αγώνας) ΠΑΟΚ - Πανιώνιος 2-0 (17’ Σμολ, 88’ Σκαρτάδος)
15/02/89 Προημιτελικά (2ος αγώνας) Πανιώνιος - ΠΑΟΚ 3-0 στην παράταση (35’, 119’ Μαύρος, 47’ Αποσπόρης)
02/10/96 Φάση «32» (1ος αγώνας) ΠΑΟΚ - Πανιώνιος 4-0 (28’ Αλεξίου, 32’ πεν. Τουρσουνίδης, 38’ Πις, 70’ Κατσούρης)
14/11/96 Φάση «32» (2ος αγώνας) Πανιώνιος - ΠΑΟΚ 2-3 (84’ Σαπουντζής, 85’ Μάντζιος - 19’, 65’ Ζουμπούλης, 56’ Ντιμκόφσκι)
04/03/98 Ημιτελικά (1ος αγώνας) Πανιώνιος - ΠΑΟΚ 1-0 (90’ Βόκολος)
18/03/98 Ημιτελικά (2ος αγώνας) ΠΑΟΚ - Πανιώνιος 1-1 (82’ Βρύζας - 23’ Ναλιτζής)
27/01/2016 Προημιτελικά (1ος αγώνας) Πανιώνιος - ΠΑΟΚ 1-1 (34’ Μασούρας-15’ Πέλκας)
11/02/2016 Προημιτελικά (2ος αγώνας) ΠΑΟΚ - Πανιώνιος) 0-0