Την απόφαση να μην αγωνιστεί ξανά με την εθνική Πορτογαλίας ανακοίνωσε ο Μιγκέλ. Ο 30χρονος δεξιός μπακ της Βαλένθια έγινε ο τέταρτος ποδοσφαιριστής της «σελεσάο» μετά τους Ντέκο, Σιμάο και Πάουλο Φερέιρα, που αποσύρεται από το αντιπροσωπευτικό συγκρότημα της χώρας μετά το Παγκόσμιο Κύπελλο της Νοτίου Αφρικής.
Ο Μιγκέλ έκανε ντεμπούτο στην εθνική Πορτογαλίας στις 12 Φεβρουαρίου του 2003 απέναντι στην Ιταλία κι έλαβε μέρος στα τελικά του Euro 2004 και 2008, αλλά και σε αυτά των Μουντιάλ του 2006 και του 2010. Συνολικά πραγματοποίησε 59 συμμετοχές με το εθνόσημο σκοράροντας μία φορά.